Футбольный клуб «Гвардеец» был основан в 2010 году при поддержке группы компаний «Скворцово» и ее президента Виталия Полищука. Главным тренером команды был назначен Владислав Мальцев, который работает с коллективом и в настоящее время. Руководство клуба при комплектовании команды всегда делало ставку на опытных крымских футболистов, поигравших на самом высоком профессиональном уровне. Результат не заставил себя долго ждать. В 2010 году в своем дебютном сезоне в первенстве Крыма «Гвардеец» стал серебряным призером, уступив лишь два очка красноперекопскому «Химику». Следующие четыре сезона «гвардейцы» безраздельно властвовали в любительском футболе Крыма, став чемпионами в 2011, 2012, 2013 и 2014-м гг. и выиграв Кубок Крыма в 2013-м и 2014 годах. В 2011 году команда дошла до финала любительского Кубка Украины.
В 2015 году «Гвардеец» стал участником Всекрымского турнира, по итогам которого формировалась Премьер-лига Крымского футбольного союза. Команда выиграла групповой этап соревнований и вышла в финал, где уступила 2:6 победителю другой группы – ФК «Севастополь». Несмотря на достигнутый результат, «Гвардеец» остался за бортом профессионального футбола, так как состав Премьер-лиги определялся по принципу: один город – одна команда. В Крымском футбольном союзе отдали предпочтение симферопольской «ТСК-Таврии», а представитель Симферопольского района продолжил выступления в Открытом чемпионате Республики Крым.
В сезоне 2015/16 гг. «Гвардеец» стал вторым в чемпионате любительских коллективов Крыма и в переходных играх за право участвовать в Премьер-лиге КФС дважды уступил ялтинскому «Рубину» – 1:2 и 0:1. В сезоне 2016/17 гг. команда стала победителем Открытого чемпионата Республики Крым, но от повышения в классе отказалась. В прошедшем сезоне «Гвардеец» выиграл «серебро» первенства Крыма, но из-за того, что победитель турнира – «Артек», не стал переходить в профессиональный футбол, коллектив из Симферопольского района напрямую пополнил ряды Премьер-лиги КФС. Накануне старта чемпионата ФК «Гвардеец» поменял прописку и теперь представляет село Скворцово Симферопольского района, где расположены основные производственные мощности главного спонсора команды.
ФК «Гвардеец» неудачно дебютировал в чемпионате Премьер-лиги КФС, завершив первый круг с 4 очками на последнем месте. В Севастополе «гвардейцы» сумели добыть ничью – 1:1. Случилось это 1 сентября 2018 г. в рамках 3-го тура чемпионата Премьер-лиги КФС.