Профессиональный футбольный клуб «Евпатория» был создан в 2015 году по инициативе президента федерации футбола города Романа Тихончука. Во Всекрымском турнире 2015 года команда выступила крайне неудачно, проиграв все девять игр и заняв в своей группе последнее место. Тем не менее как представитель Евпатории коллектив был включен в созданную Премьер-лигу КФС и в дебютном сезоне 2015/16 гг. смог выступить успешно, заняв итоговое четвертое место. От чемпионата к чемпионату ФК «Евпатория» улучшала свои турнирные показатели, став обладателем бронзовых медалей и Кубка КФС в сезоне 2016/17 гг. и сильнейшей командой Премьер-лиги КФС сезона 2017/18 гг.
После победного чемпионата главный тренер и ведущие игроки покинули «Евпаторию» и наставнику команды Сергею Величко пришлось в срочном порядке формировать новый коллектив. Первый круг команда завершила на 5-м месте, обыграв «Инкомспорт» – 2:1, «Гвардеец» – 2:0. «Океан» – 4:2, сыграв вничью с «Крымтеплицей» – 2:2 и проиграв «Севастополю» – 0:3, «ТСК-Таврии» – 1:3 и «Кызылташу» – 0:2.
Последняя очная встреча «Севастополя» и «Евпатории» состоялась 18 августа 2018 года в городе-герое – в день открытия чемпионата Премьер-лиги КФС сезона 2018/19 гг. и завершилась победой хозяев поля – 3:0.
В рамках чемпионата Премьер-лиги и Кубка КФС футбольный клуб «Севастополь» сыграл с «Евпаторией» 17 матчей. 8 побед на счету нашей команды, 7 поединков выиграли евпаторийцы, и в двух случаях была зафиксирована ничья. Разница мячей – 30:35 в пользу команды из города-курорта.
Необходимо отметить тот факт, что накануне старта второго круга чемпионата шесть игроков «Евпатории», вместе с главным тренером Сергеем Величко, побывали в Москве, где в составе делегации Крымского федерального университета им.Вернадского приняли участие в третьем межрегиональном турнире Премьер-группы Национальной студенческой футбольной лиги России. Команда КФУ выиграла у РЭУ (Москва) – 3:2, сыграла вничью с СГАФКСТ (Смоленск) – 1:1 и проиграла КубГУ (Краснодар) – 1:0. В составе КФУ на поле выходили евпаторийцы: вратарь Валентин Манякин, защитники Денис Ситников, Дмитрий Попович и Денис Величко, полузащитник Длявер Нуридинов и нападающий Евгений Харченко.